Calvijn vond dat de kerkenraad het hoogste orgaan van de kerk moest zijn. De kritiek van Luther en Calvijn op de kerk kwam grotendeels overeen, maar over enkele onderwerpen verschilden ze toch van mening.
- Vorst afzetten als het een tiran was.
predestinatieleer: het lot van elk mens is al voorbestemd bij de geboorte.
De manier waarop je leefde kon hier niets aan veranderen