Directe ELISA is sneller maar ook duurder omdat je maar 1 soort antilichaam hebt. Elk antilichaam moet daarom specifiek passen op het antigeen dat je wil testen. Wel heb je minder kans op fouten tijdens de procedure.
Indirecte ELISA duurt langer maar is specifieker.
De 2 antilichamen werken als een soort extra controle voor je.
Bijkomend is ook dat antilichaam 2 op alle antilichaam 1's in je voorraadkast zou kunnen passen. Daardoor heb je veel minder dure specifieke antilichamen nodig, meer flexibiliteit.
Als risico heeft de Indirecte ELISA meer kans op kruisreactiviteit (waarbij er reacties optreden met dingen die je niet wil testen).