17.4 Het belang van de nucleotidevolgorde

• Biologie
• Middelbare school
• vwo
• Leerjaar 6

Paragraaf 1 Dierenwelzijn

Paragraaf 17.4 Het belang van de nucleotidevolgorde

Doel en begrippen 17.4

Je leert welke typen mutaties er zijn en welke effecten ze hebben op een organisme

sequencen, ddNTP`s, mutaties, puntmutatie, substitutie, deletie, insertie, chromosoommutatie, inversie, duplicatie, translocatie, genoommutatie, mutageen, leesraamverschuiving, tumorsuppresorgenen, proto-oncogenen, restrictie-enzymen, transgen, cisgen

Sequencing

Het bepalen van de nucelotidevolgorde van DNA.

Met behulp van PCR in combinatie met dNTP's en ddNTP's =

nucleotiden met een H groep aan de 3` kant ipv een OH groep waardoor er geen nieuwe nucleotide aangezet kan worden.

Daarna volgt capillairelectroforese.

Vraag 4

(uit het boek, pag 28)

Vraag 4

(uit het boek, pag 28)

Leg uit of dit nucleotide correspondeert met het 3’- of het 5’-einde van de streng waarlangs de PCR heeft plaatsgevonden.

Welke basenvolgorde is af te lezen
uit deze gel?

1. 3'-TCGTAGACTCA-5'
2. 3'-ACTCAGATGCT-5'
3. 3'-AGCATCTGAGT-5'
4. 3'-TGAGTCTACGA-5'

Vraag 4

(uit het boek, pag 28)

Soorten mutaties

Puntmutatie: verandering van één nucleotide

Chromosoommutatie: verandering in een chromosoom

Genoommutatie: verandering in het aantal chromosomen

Leesraamverschuiving (frameshift)

Als gevolg van een insertie

of deletie wordt een totaal

ander eiwit gecodeerd.

Of er ontstaat op een andere

plek een start- of stopcodon.

Wanneer hoeven mutaties geen gevolgen te hebben? (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)

1. Als ze plaatsvinden in introns
2. Als ze plaatsvinden in exons
3. Als ze plaatsvinden in STR's

Introns bevatten niet-coderend DNA. Mutaties zijn daarom meestal niet zichtbaar in het fenotype, tenzij het een mutatie betreft in een regulatorgen.

Mutaties in exons kunnen ook synoniem zijn, dus een substitie wat leidt tot hetzelfde aminozuur.

STR's bevinden zich in niet-coderend DNA

Gevolgen van mutaties - plaats

• Mutatie in een niet-coderend deel van het DNA => gevolgen nihil, behalve bij genregulatie-deel
• Mutatie in coderend deel => gevolgen wisselend 
• Bijvoorbeeld in wiebelbase => geen gevolgen
• Verandering van de aminozuurvolgorde => kleine tot zeer grote gevolgen

Gevolgen van mutaties - celtype

• Mutatie in een inactief gen van een weefselcel => geen gevolgen
• Mutatie in een stamcel => kleine tot grote gevolgen
• Mutatie in een geslachtscel => kleine tot grote gevolgen

Verstoringen celcyclus

Tumorsuppressor genen: genen die de celdeling remmen of apoptose (gecontroleerde celdood) stimuleren.

Als er een mutatie in een dergelijk gen optreedt kan een tumor ontstaan.

Proto-oncogenen: genen die de celdeling stimuleren.

Als er een mutatie in een dergelijk gen optreedt waardoor het actiever wordt kan een tumor ontstaan.

Genetische modificatie

Het aanpassen van het DNA van een organisme heet genetische modificatie.

Als een organisme DNA van een ander soort organisme krijgt ingebouwd heet dit een transgeen organisme.

Als een organisme DNA van een zelfde soort organisme krijgt ingebouwd heet dat een cisgeen organisme

BINAS 71M1

Genetische modificatie

Genetische modificatie 

                                      

Genetische modificatie

Genetische modificatie

Genetische modificatie

Vraag 6

(uit het boek, pag 29)

Vraag 6a)
Wat is de lengte in basenparen van de DNA-fragmenten bij een reactie met het restrictie-enzym BamHI?

1. 1000 en 1500
2. 500, 1000 en 1500
3. 500 en 1000
4. 500 en 2500

Vraag 6

(uit het boek, pag 29)

Vraag 6b)
Na een reactie met restrictie-enzymen ontstaan DNA-fragmenten van 400, 800 en 1800bp. Welke restrictie-enzymen zijn gebruikt?

1. Alleen EcoRI
2. EcoRI en HindIII
3. HindIII en BamHI
4. EcoRI en HindIII

Vraag 6

(uit het boek, pag 29)

recombinante-DNA-techniek

Waarom wordt er altijd een gen voor antibioticum resistentie in het plasmide ingebouwd?

1. Anders werkt het plasmide niet goed
2. Anders neemt de bacterie het plasmide niet op
3. Dan kan er getest worden of het plasmide is opgenomen
4. Dit maakt de techniek makkelijker om uit te voeren

Hoe goed begrijp je de stof al?
van 17.1 t/m 17.4?

😒🙁😐🙂😃